คณะประมงมีความร่วมมือกับหน่วยงานทั้งในประเทศ และต่างประเทศ ทางด้านการศึกษา การวิจัยและนวัตกรรม มีการแลกเปลี่ยนนิสิต บุคลากร และเครื่องมือ เพื่อให้ได้การศึกษาและการวิจัยทางด้านประมงที่ครบวงจรและมีประสิทธิภาพ
หน่วยงานภายในประเทศ
หน่วยงานภาครัฐ
- กรมประมง
- กรมทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่ง
- สำนักงานพัฒนาเทคโนโลยีอวกาศและภูมิสารสนเทศ (องค์การมหาชน)
- สมาคมวิทยาศาสตร์การประมงแห่งประเทศไทย
- มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลสุวรรณภูมิ
- สถาบันสารสนเทศทรัพยากรน้ำและการเกษตร
หน่วยงานเอกชน
- บริษัท มานิตย์ฟาร์ม อาหารสัตว์ จำกัด
- มูลนิธิเจริญโภคภัณฑ์
- สมาคมอาหารแช่เยือกแข็งไทย
- บริษัท อินโดรามา เวนเจอร์ส จำกัด
- บริษัท ปตท. จำกัด (มหาชน)
หน่วยงานระหว่างประเทศ
- Network of Aquaculture Centres in Asia-Pacific (NACA), ประเทศไทย
- Southeast Asian Fisheries Development Center / Training Department (SEAFDEC), ประเทศไทย
- Tokyo University of Marine Science and Technology, ประเทศญี่ปุ่น
- Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS), ประเทศญี่ปุ่น
- Tohoku University, ประเทศญี่ปุ่น
- Faculty of Fisheries Sciences, Hokkaido University, ประเทศญี่ปุ่น
- Fisheries Department, Faculty of Agriculture-Animal Husbandry University of Muhammadiyah Malang, ประเทศอินโดนีเซีย
- University of Kumamoto, ประเทศญี่ปุ่น
- Faculty of Fisheries and Marine Science, Sam Ratulangi University, ประเทศอินโดนีเซีย
- Faculty of Fisheries, Kagoshima University, ประเทศญี่ปุ่น
- College of Fisheries and Ocean Sciences, The University of the Philippines Visayas, ประเทศฟิลิปปินส์
- The Ocean University of China, ประเทศจีน
- Universiti Malaysia Terengganu, ประเทศมาเลเซีย
- Graduate School of Biosphere Science, Hiroshima University, ประเทศญี่ปุ่น
- China-ASEAN Center for Joint Research and Promotion of Marine Aquaculture Technology and School of Marine Sciences, Sun Yat-sen University, ประเทศจีน
- Stichting Deltares, ประเทศเนเธอร์แลนด์
- James Cook University, ประเทศออสเตรเลีย
- Graduate School of Bioresource and Bioenvironmental Science, School of Agriculture, ประเทศญี่ปุ่น
- Kochi University, ประเทศญี่ปุ่น
- Faculty of Fisheries and Marine Science, University of Brawijaya, ประเทศอินโดนีเซีย
- Institute of Oceanography, National Taiwan University, ประเทศไต้หวัน